La limonite se rencontre en concrétions, en rognons, en masses amorphes ou compactes, en grains, en masse terreuse, en fines particules en suspension dans l'eau, ou en agglomérats de cristaux de quelques microns difficiles à voir même au microscope. La couleur va du brun jaunâtre au brun foncé, noire en surface des rognons et concrétions.